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癌症遗传筛选资源库迈向新台阶,CRISPR-Cas9数据集分析更加全面!
【本文为疾病百科知识,仅供阅读】 2019-12-26 作者:厚朴方舟
在验证了725种癌症模型中跨越25种不同癌症类型的两个较大的CRISPR-Cas9基因筛选之后,对于癌症生存所必需的基因的全面图谱又近了一步。惠康桑格研究所(WellcomeSangerInstitute)和麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所的科学家比较了这两个数据集的一致性,并独立地验证了方法和发现。
该结果于今天(2019年12月20日)在《自然通讯》上发表,这意味着可以将这两个数据集整合起来,形成迄今为止较大的癌细胞系遗传筛选,这将为约1,000种癌症模型中的癌症依赖图提供基础。该组合数据集的规模将有助于加快新癌症药物的发现和开发。
癌症依赖图(CancerDepMap)计划旨在为患者创建详细的准确癌症治疗规则手册。癌症DepMap的两个关键要素是对癌细胞存活至关重要的基因的作图和所得数据集的分析。尽管近日癌症研究取得了进展,但要使准确医学广泛用于癌症患者仍需要许多新的药物靶标。
在这项新研究中,研究人员分析了在Broad和Sanger研究所对癌细胞系进行的两个近期发表的CRISPR-Cas9基因筛选的数据。尽管实验方案存在显着差异,该小组发现筛选结果彼此一致。至关重要的是,在两个数据集中都发现了对癌症生存至关重要的相同基因(称为依赖性)。
这项研究验证了CRISPR-Cas9功能基因筛选的可重复性,以消除对其功效的怀疑。它为评估这些新类型的数据集设定了严格的标准,从而促进了大型癌症依赖数据库的比较和集成。
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