近日，在《Nature Immunology》杂志上发表的一项研究论文中提到，麻省理工学院的研究人员设计出一种新方法，可以鉴定具有特定靶标的T细胞。该论文的主要作者是研究生Ang Andy Tu和博士后Todd Gierahn。

通过高通量单细胞RNA测序，能够确定某一细胞在给定时间的基因表达情况，进而揭示该T细胞的独特功能。研究人员通过使用这种方法来研究患者的T细胞对花生过敏的特征，进而开发针对花生过敏的特定治疗方法，并确定该治疗方法是否对特定患者有效。此类研究还可以指导研究人员开发和测试其他的新治疗方法。

这一新方法建立在先前大量工作开发的技能基础上。该技能可以在大量细胞上快速执行单细胞RNA测序。通过对信使RNA进行测序，科学家可以发现在给定时间表达的基因，从而使他们了解单个细胞的功能。

T细胞在免疫反应中具有许多不同的作用。然而，之前的RNA测序研究无法准确发现对特定靶标或抗原有反应的T细胞群体。这是由T细胞受体(TCR)的序列特征决定的。单细胞RNA测序通常仅标记和测序每个RNA分子的其中一端，而T细胞受体基因的大部分变异都位于序列的另一端，因此常规的测序手段无法确定T细胞的受体信息。

在单个T细胞中，编码T细胞受体的RNA不足细胞总RNA的1%，因此MIT小组提出了一种新方法：扩增这些特定RNA分子，然后将其从总样品中“拉出”。每个RNA分子都标记有条形码，以揭示其细胞来源信息，因此研究人员可以将T细胞的靶标与其RNA表达方式进行匹配。由此可以确定哪些基因在靶向特定抗原的T细胞群体中具有活性。

“要进一步了解T细胞的功能，就必须了解它们的受体识别的靶点信息。这种方法可以利用现有的单细胞RNA测序文库，并提取想要表征的相关序列。”研究人员说，该技能的另一个优点是它不需要使用昂贵的化学试剂，许多实验室已经拥有的设备和先前处理过的样品就可以完成。

研究人员在论文中说，给小鼠接种了针对人乳头瘤病毒的疫苗后，可以使用该方法筛选出对该病毒产生活性反应的小鼠T细胞。他们发现，尽管所有T细胞都对病毒起反应，但这些细胞却有不同的TCR，并且处于不同的发育阶段：一部分T细胞被激活，并杀死被感染的细胞，而另一些则专注于生长和分裂。

然后，研究人员分析了四名对花生过敏患者的T细胞。将细胞暴露于花生过敏原后，他们能够鉴定出对过敏原具有活性的T细胞，同时还显示出T细胞的哪些亚群是较为活跃的，并发现了一些与过敏反应有关的炎性细胞因子。

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